泽塔奥特曼是赛罗奥特曼的徒弟,拥有着和赛罗一样的热心肠,是一位非常积极向上的奥特英雄。而且,泽塔非常崇拜他的师父赛罗。赛罗虽然嘴上不承认这个徒弟,但其实心里还是很看好泽塔的。这次和泽塔奥特曼有关的人类,是一位名叫夏川遥辉的热血青年。遥辉是怪兽应对机甲部队“军械库”的一名队员。在很久很久以前,由于某种原因,宇宙中出现了一种叫恶魔碎片的东西,它可以让怪兽失去理智。一个神秘的家伙正借助这些恶魔碎片危害四方,并将其魔爪伸向了光之国。赛罗和他的徒弟泽塔为了守卫家园,主动出击迎战敌人。一场激战过后,泽塔被迫与赛罗分开,独自一人追逐逃跑的怪兽。泽塔抵达地球的时候,遇到了正在战斗的遥辉。两人的相遇,拉开了故事的序幕。